Дирекция создана в середине 2006 года на базе двух специализированных морских инспекций, осуществлявших деятельность в Южном федеральном округе: Черноморо-Азовской (г. Новороссийск) и Азовской (г. Таганрог) (распоряжение Правительства Российской Федерации от 06. 06. 2006г. №833-р).
С декабря 2011 года Черноморо-Азовская дирекция является федеральным бюджетным учреждением (ФБУ "Черноморо-Азовская дирекция по техническому обеспечению надзора на море" — ФБУ "ЧерАзтехмордирекция").
В состав Учреждения входят структурные подразделения в городах: Таганрог, Ростов-на-Дону, Ейск, Сочи, Туапсе, Темрюк, имеющие маломерный флот и автотранспорт.
В зону деятельности дирекции также входит акватория Черного и Азовского морей на территории Российской Федерации и их водоохранные зоны.
ФБУ "ЧерАзтехмордирекция" имеет собственную аккредитованную экоаналитическую лабораторию (аттестат аккредитации РОСС RU.0001. 21. АИ01 от 21. 01. 2014г) и лицензию в области гидрометеорологии и в смежных с ней областях №Р/2014/2519/100/Л от 07. 03. 2014г.
Учреждение является надежным партнером на рынке предоставления природоохранных услуг с многолетним опытом работы.
